موحدی کرمانی در شرایطی با رای اعضا برای یک دوره دوساله به عنوان رییس مجلس خبرگان تعیین شد که در تمام دوره‌های مجلس خبرگان نیز از حوزه انتخابیه کرمان عضو این مجلس بوده است. موحدی کرمانی پس از پیروزی انقلاب اسلامی و تاسیس حزب جمهوری اسلامی، مدتی به ‎عنوان عضو شورای مرکزی و عضو شورای داوری این حزب مشغول فعالیت بود و با شکل‌گیری مجالس شورای اسلامی و خبرگان رهبری، وارد این دو نهاد شد.